A Misericórdia também assume uma componente de educação através de Atividades de Tempos Livres (ATL), que funciona nas antigas instalações da instituição. Este serviço, inaugurado em 1984, é destinado a todas as crianças e funciona durante o período de férias bem como quando estas saem da escola, até às 19 horas. Desta forma, os pais têm um espaço disponível para deixar os seus filhos, acompanhados por técnicos, onde podem praticar diversas atividades, nomeadamente escolares ou lúdico-recreativas. A pensar no bem-estar das crianças medenses, a Santa Casa não encerra este serviço em qualquer período de férias.
